Von 1987 bis 2002 war Thomas Bechtler Präsident der Zürcher Kunstgesellschaft, des Kunsthauses Zürich. In seiner Präsidialzeit wurde die Renovation des Kunsthauses in die Wege geleitet, zügelte die Administration des Kunsthauses in die Villa Tobler und wurde das Konzept für den Erweiterungsbau am Pfauen lanciert. Thomas Bechtler engagiert sich weiterhin zu Gunsten des Kunsthauses Zürich.

Thomas Bechtler führt zudem gemeinsam mit seinem Bruder die Walter A. Bechtler Stiftung, welche vorwiegend grosse und anspruchsvolle Werke zeitgenössischer Kunst im öffentlichen Raum oder in Museen platziert.